O Programa de Capacitação de Recursos Humanos objetiva fomentar a qualificação do corpo docente e dos recursos humanos das Instituições de Educação Superior e de outras entidades conveniadas, abrangendo as seguintes modalidades: Aperfeiçoamento, Especialização, Mestrado, Mestrado-sanduíche, Doutorado, Doutorado-sanduíche e Pós-Doutorado. 

O Programa de Bolsas de Fomento à Pesquisa/Desenvolvimento/Inovação objetiva incentivar a institucionalização da pesquisa e contribuir para a implantação da pós-graduação stricto sensu nas Instituições de Educação Superior; fomentar processos de inovação e estimular interação das IES com o setor produtivo. Abrange as seguintes modalidades: Iniciação Científica Júnior, Iniciação Científica, Iniciação Tecnológica, Recém-Mestre, Recém Doutor, Pesquisa e Desenvolvimento, Pesquisador Visitante, Inovação para Competitividade Empresarial e Apoio Técnico a Projetos de Pesquisa/Desenvolvimento/Inovação.